猫が無くなってから、1年以上経過していれば、ウィルスは残っていないでしょう。 （道具の消毒も、しなくても良いと思います。） 免疫力が低下する病気の「猫白血病、猫エイズ」ウィルスは、猫の体外に出てしまうと数時間で感染力が無くなります。 猫風邪の、「猫ヘルペス、猫カリシ」ウィルスは、猫の体外では一か月もすれば感染力が無くなります。 重篤な腸炎になる「猫パルボ」ウィルスでも1年ほどで消滅します。（書かれている症状からは、猫パルボではなかったでしょう。）
https://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q12279512072
